一、历史上微生物学对医学的贡献
　　1796年英国医生Edward Jenner发明种牛痘预防天花，开创了预防接种方法，并为人类最终消灭天花作出了贡献。1862年法国微生物学家Louis Pateur首先揭示了病原体作用，创造了巴氏消毒法，一直沿用至今。1867年英国外科医生Joseph Lister创造了外科消毒方法，倡导无菌手术，大大推动了外科学的发展。1910年德国细菌学家PaulEhrlich首先用砷凡钠明治疗梅毒，并获得成功，揭开了现代化学疗法的序幕。1928年英国细菌学Alexander Fleming发明青霉素，从而开创抗生素时代。1985年美国的Gall和法国的Montagnier共同发现HIV序列，为人类AIDS奠定了基础。
二、临床微生物学发展的几个重要阶段
　　从公元前400年希腊医生Hippocrates主张要对患者进行整体观察和全面体格检查以来，一直停留在经验诊断的阶段。1676年荷兰的Leeuwenhock(Holland)发明原始显微镜，并发现微生物及其形态，开创了实验诊断学，为从经验医学过渡到实验医学，最终进入现代医学奠定了基础。1877年德国细菌学家Robert Koch首先证明病原体、机体和疾病三者之间的关系，提出了著名的能够证明微生物是传染病的致病因子Koch原则，发明了分离培养细菌的固体培养基，并首先发现炭疽杆菌、结核杆菌、霍乱弧菌，此后20年中，临床微生物学进入飞速发展阶段，至本世纪初几乎所有的致病菌均被分离。
三、本世纪临床微生物学的发展
　　70年代：计算机和数码信息技术的发展并与微生物技术相结合，诞生了微生物编码鉴定技术，进一步创造出半自动和全自动微生物鉴定和药敏分析仪，使传统的微生物手工操作技术进入了自动化和电脑化的时代。80年代：免疫学技术的飞速发展并向微生物领域渗透，各种免疫标记和分析技术的应用，从传统的酶、荧光和放射免疫测定技术到时间分辨荧光、电化学发光等技术的发展大大提高了免疫分析的敏感性，而单克隆抗体制备和多肽抗原合成技术大大提高了免疫反应的特异性，加之自动免疫分析仪的诞生，为感染性疾病的血清学诊断提供了许多简便、快速、灵敏和特异的新的手段。　　90年代：分子生物学技术的发展，限制性内切酶、DNA杂交、测序和扩增技术的应用，使某些不能培养、培养需很长时间和特殊条件的微生物引起的感染性疾病的基因诊断成为可能。
四、世纪末的挑战
　　（一）新传染病的出现
　　在世纪末临床微生物学受到的挑战之一是出现了许多新病原体及其引起的新传染病，人们对新传染病的认识和准备不足，缺乏有效的预防、诊断和治疗措施，人群无免疫力，因些来势凶、传播快、范围广、传播途径多，往往造成巨大的经济损失和社会影响，专家预测到2000年全世界将为此多支出3500-5000亿USD。如O157出血性肠炎、疯牛病、O139霍乱、艾滋病、埃博拉出血热、新型肝炎病毒、埃立克体和肺炎衣原体感染、莱姆病、肠病毒71、手足口病等等共出现新传染病31种，其中病毒病14种、细菌病11种和寄生虫病6种，均在世界不同的地区和范围内造成巨大的损失和影响。
　　（二）多重耐药细菌的出现
　　本世纪未临床微生物学受到的挑战之二是出现了许多多重耐药的细菌，当前细菌的耐药性问题主要集中在以下6方面，如耐苯唑西林、并对万古霉素敏感性降低葡萄球菌（MRS）、耐青霉素和多重耐药的肺炎链球菌（PRP）、耐万古霉素的肠球菌（VRE）、产生超广谱β内酰胺酶（ESBL）的肺炎克雷白菌和大肠艾希菌、持续高产染色体I型酶的阴沟、产气肠杆菌和弗劳地枸椽酸杆菌等细菌以及多重耐药的铜绿假单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌和不动杆菌。多重耐药菌株的出现可导致抗　感染治疗失败、造成患者往院天数延长、医疗费用增加和死亡率的上升，使临床抗感染治疗遇到前所未有的困难。
　　五、临床微生物学如何立足现状、面向未来
　　（一）、坚持传统与现代相结合
　　传统的细菌涂片染色、分离培养仍是不可缺少的"金标准"，现代免疫学和分子生物学技术不能取代传统的细菌学技术，我们对于新技术的态度应该是积极引进、努力学习、不断研究、并对这此新技术在本学科中所起的作用正确评价。
　　（二）掌握现代感染类型的变化趋势
　　现代感染的特征是由条件致病菌影响免疫低下机体引起全身各系统的感染。现代感染类型的变化　趋势体现在病原体种类的变迁（致病菌－条件致病菌）；细菌耐药性的变迁（敏感菌－耐药菌）；和机体易感性的变化（正常人－免疫力低下机体）。
　　（三）做好医院感染的防治和监控
　　医院感染的监测包括：病人的准确统计、病原体和耐药性的精确分析、消毒灭菌的质量控制、危险因素的相关分析、相关病区重点监测、医院感染暴发流行的及时发现和控制以及病人、医护人员和环境的消毒隔离。
(四）做好细菌耐药性监测
　　鉴于目前耐药性的问题日趋严重，应准确地做好常规的抗生素敏感试验，并保存有关的菌种和数据以便进一步分析，包括耐药趋势的统计分析、耐药机制的检测和研究、重点耐药菌株如MRSA、VRE和ESBL等的监测和相关耐药基因的检测等。
　　（五）做好标准化和QC
　　长期以来，临床微生物检验的特点是以手工操作为主，以定性检测为主，其结果的可比性很差，往往没有一个肯定的衡量标准，操作人员个的经验、学识和责任性对结果的影响很大，因此急待做好临床微生物检验的标准化和QC工作。包括制订详细的操作规程；培养基、试剂和诊断血的制备、保存和定期质检；药敏方法和判断标准的标准化；必备参考书、标准品、标准菌种的储备、保存和应用等，必须对微生物检验室实行QC和全面的质量管理。
　　（六）做好人员培训和教育
　　做好在职人员培训和再教育关系到学科的发展和梯队建设，并与提高临床微生物检验的质量和水平密切相关。应帮助年青一代掌握本学科新的动向（现代感染的病原体和耐药性变化趋势）、新的知识（新病原体、新的细菌分类和命名）和新的技能（免疫学、分子生物学），并提高外语和计算机的水平，要制订明确的培养计划和目标，并定期进行理论和操作技能考试，为进一步与国际接轨，实行实验室认证和操作人员资格认定做好准备。
　　六、对新世纪的展望
　　计算机全球网络化和数码信息革命标志着一个全新的知识经济时代的到来，与此同时在生命科学领域中分子生物学的飞速发展，分子克隆技术和人类基因计划的实施，离人类真正揭示生命和疾病的本质已为时不远。在临床微生物学检验方面，自动化、电脑数码化、DNA直接测序和比对（DNA芯片）等技术的发展日新月异，作出及时准确的病原学诊断、控制和消灭某些严重危害人类健康的感染性疾病仍是我们追求的目标。全体微生物工作者须努力跟上新时代的步伐，使微生物学这门古老的学科重新焕发出青春的光彩。