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2型糖尿病患者线粒体DNA ND1基因 3394 T→C 突变的检测


[ 来源:达安基因 | 作者:何雪岷, 周新 | 时间:2006-9-29 20:03:02 | 浏览: ]

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何雪岷, 周新

(武汉大学中南医院检验科,湖北 武汉 430071)

【摘要】目的 探讨线粒体DNA ND1基因3394 (T→C) 突变与武汉地区人群2型糖尿病的关系。方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和测序的分析方法,对95例2型糖尿病患者和168例健康对照进行筛选,并用DNAMAN、Primer和mfold软件进行二级结构预测分析。结果 实验组检出3394 (T→C) 突变3例 (3.2%), 对照组未检出突变,两组间突变率差异有统计学意义(P<0.05)。3394 (T→C) 突变导致Tyr→His ,mfold软件预测显示3394突变后ND1基因DNA二级结构不同于野生型。结论 线粒体DNA ND1基因3394 (T→C) 突变,可能与2型糖尿病的发生发展有关。

【关键词】线粒体DNA; 突变; 2型糖尿病; 二级结构预测



Mitochondrial DNA ND1 gene 3394 (T→C) point mutation and type 2 diabetes mellitus

HE Xuemin,ZHOU Xin. Zhongnan Hospital of Wuhan University, Wuhan 430071, China.

Abstract: Objective To explore the relationship between mitochondrial DNA point mutation of 3394 T→C and type 2 diabetes mellitus(T2DM) in Wuhan population. Methods 95 cases of T2DM and 168 healthy controls were determined by PCR-restriction fragment length polymorphism and DNA sequencing. All mutations were analyzed by DNAMAN,Primer and mfold softwares. Results In diabetic group, there were 3 carriers (3.2%) of 3394 T→C (Tyr→His) mutation; None carrier was found In controls. There was significant difference between two groups for np3394 mutation frequencies (P < 0.05). The secondary structure prediction revealed that there were differences between np3394 mutant and wild-type ND1 gene. Conclusion mtDNA ND1 gene mutations at np3394 might implicate in the pathogenesis of T2DM.

Key words: Mitochondrial DNA;mutation;T2DM;Secondary structure prediction



线粒体基因是目前发现的除核基因以外惟一存在于人细胞质中的DNA分子,具有自我复制、转录和编码功能。线粒体基因缺陷可导致胰岛素分泌障碍[1-5],从而参与糖尿病的发生。有关糖尿病与mtDNA基因突变的研究国内外有很多报道,其结果不一。本文采用PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、DNA测序和结构预测的分析方法,对武汉地区95例2型糖尿病(T2DM)患者和168名健康对照mtDNA的ND1基因(np3307~4263)的3394(T→C)突变位点进行筛选检测,结果如下。



1 对象和方法



1.1 对 象

按照1997年美国糖尿病学会制订的T2DM诊断标准, 确认实验组患者95例(男61, 女34), 平均年龄58岁,均无亲缘关系。对照组为健康体检者168名(男101, 女67), 平均年龄57岁。两组年龄和性别均匹配(P>0.05)。对照组排除糖代谢、脂代谢和内分泌紊乱的相关疾病,临床检查和实验室检查结果未见异常。



1.2 方 法

用NaI方法提取EDTA抗凝外周血DNA作为模板。参考文献[2]设计引物,P1 :5’-AGCGC CTTCCCCCGTAAATG-3,p2: 5’-AGAATGATGGCTAGGGTGACTT-3’(引物由武汉伯杰公司合成);扩增产物长度为596bp,经1%琼脂糖电泳鉴定后,用内切酶HaeⅢ进行酶切。20μl反应体系包括:10×Buffer 2μl,10mg/ml BSA 0.5μl ,PCR产物6μl,HaeⅢ 1U,37℃水浴16小时。所有酶切产物经8%聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染显影观察结果。将电泳条带不同于野生型的PCR产物进行双向测序,并经DNAMAN和Primer软件分析,鉴定突变位点及其编码相应氨基酸的改变,采用mfold软件对野生型和突变后的ND1基因进行二级结构预测。



1.3 统计分析

采用SPSS 11.0统计软件的Fisher 精确概率法、χ2检验进行分析,统计检验水平为双侧0.05。



2 结 果



2.1 HaeⅢ酶切结果

HaeⅢ切割位点为gg^cc, 无突变者,在3316、3413、3428和3608处存在酶切位点,酶切产物均为180bp,157bp,147bp,97bp,15bp五个片段。如果发生3394 T→C突变(Tyr→His),新的酶切位点将97bp片段切为76bp和21bp两个片段,酶切产物有六个片段,但由于21bp太小,在图中观察不到,结果见图1。本研究在实验组发现np3394突变3例(3.2%),对照组未检出突变。两组间np3394突变率差异有统计学意义(P< 0.05)。



2.3 ND1基因二级结构预测分析

Primer软件分析显示3394(T→C)突变,编码的相应氨基酸有改变,mfold软件也证实了其二级结构(图3b)与野生型(图3a)不相同。



3 讨 论



1992年,Nakagawa和Ouweland等[1]分别报道了线粒体tRNALeu(UUR) 3243 A →G突变与糖尿病的关系而受到各国学者的重视。近年来国内也对线粒体基因突变与糖尿病关系进行了研究[4,5],结果表明基因突变易使患糖尿病的易感性增加。

本文通过HaeⅢ酶切和测序研究, 对95例T2DM患者和168例健康对照mtDNA ND1基因 3394(T→C))突变进行了筛选。实验表明,3394(T→C)突变率在实验组为3.2%,对照组为0%,两组差异有统计学意义。该突变位于ND1基因,是ND基因中最保守的,其表达产物为NADH 脱氢酶(复合体Ⅰ)亚单位Ⅰ[1]。Primer软件分析显示 np3394突变, 使一个亲水性中性 酪氨酸( Tyr)被亲水性的碱性组氨酸( His)取代,mfold软件预测其最小自由能下的二级结构(图3b)发生了明显的改变,据此推测,该突变影响呼吸链复合体Ⅰ酶活性,导致线粒体氧化磷酸化功能受损,减少ATP生成, 而胰岛B细胞所需能量的94 % 来自呼吸链,降低胰岛β细胞分泌胰岛素的能力,延迟胰岛素释放,促使了糖尿病的发生发展[1-5]。



参考文献

[1] Nakagawa Y,Ikegami H,Yamato E,et al.A new mitochondrial DNA mutation associated with non insulin dependent diabetes mellitus[J]..Bio Chem Biophys Res Commun,1995,209:664-668.

[2] Fukuda M, Nakano S, Imaizumi N, et al. Mitochondrial DNA mutations are associated with both decreased insulin secretion and advanced microvascular complications in Japanese diabetic subjects.[J]. J Diabetes Complications, 1999, 13: 277-283.

[3] Perucca-Lostanlen D, Narbonne H, Hernandez JB, et al . Mitochondrial DNA Variations in Patients with Maternally Inherited Diabetes and Deafness Syndrome[J]. Biochem Biophys Res Commun, 2000,277: 771–775.

[4] 钱杰 张丽容。线粒体DNA ND1基因点突变与2型糖尿病的关系[J].中华内分泌代谢杂志,2003,19(1):46-47.

[5] YU P , YU DM , LIU DM , et al. Relationship between mutations of mitochondrial DNA ND1 gene and type 2 diabetes[J]. Chin Med J (Engl) , 2004, 117 : 985-989.

来源:达安基因    



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原始作者: 何雪岷, 周新 录入时间: 2006-9-29 20:03:02
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