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肿瘤细胞五种细胞因子基因检测方法的建立


[ 来源:中华医学检验杂志 | 作者:刘杰 魏海明 田志刚 冯进波 | 时间:2006-9-20 17:29:15 | 浏览: ]

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中华医学检验杂志 1998年第3期第21卷 论著摘要

作者:刘杰 魏海明 田志刚 冯进波

单位:250062 济南,山东省医学科学院基础所山东肿瘤生物治疗研究中心

  细胞因子的基础研究证明,多种细胞因子与疾病的发生发展过程有关,越来越多的细胞因子或细胞因子拮抗剂应用于疾病的治疗,建立特异而敏感的细胞因子检测方法,对解释细胞因子与疾病的关系,指导细胞因子的临床治疗十分重要,我们建立了逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和RNA斑点杂交方法,检测20株肿瘤细胞中白细胞介素(IL)-2、IL-4、IL-10、IL-13和γ干扰素(IFN)γ等5种细胞因子的表达状况,获得较好结果,现报告如下。

  一、材料和方法

  1.肿瘤细胞株:淋巴瘤细胞5株,骨髓瘤细胞2株,白血病细胞2株,肺癌细胞4株,乳腺癌细胞3株,黑色素瘤细胞2株,膀胱癌和结直肠癌细胞各1株,依各细胞性质分别行贴壁或悬浮培养。

  2.PCR引物:根据5种细胞因子和β-actin的cDNA序列,分别设计上游和下游引物,由美国Galifornia大学高斌博士合成并惠赠。

  3.RNA提取:按GIT一步法提取,紫外分光光度法测RNA含量,甲醛变性琼脂糖凝胶电泳鉴定RNA的完整性。

  4.RT反应:取5~10 μg RNA,加入0.1mol/L DTT 2 μl,莫洛尼鼠白血病病毒( M-MLV) 200 U(1 μl),4×dNTP(每种10 mmol/L) 1 μl, 下游引物P2 0.5 μl(50 pmol), 总反应体积20 μl。37℃ 1小时后,经95℃ 10分钟灭活M-MLV。

  5.PCR反应体系:20 μl RT反应产物,15 mmol/L MgCl2 13.3 μl,4×dNTP 1 μl,上游引物P1 0.5 μl(50 pmol),TaqDNA聚合酶2 μl(1 U/μl),循环条件为94℃ 1分钟,58℃ 1分钟,72℃ 1分钟,循环35次,末次72℃,延长7分钟,电泳鉴定。

  6.mRNA斑点杂交:分别含有质粒β-actin、IL-2、IFNγ、IL-4、IL-10、和IL-13的大肠杆菌菌株由本室冻存,并按常规方法提取质粒,用切口平移法标记生物素化的各细胞因子探针,按本室常规进行mRNA斑点杂交。

  二、结果

  1.RT-PCR检测5种细胞因子基因表达实验条件的选择:以IL-10为例选择不同RNA量,分别用Oligo dT12~18,单一下游引物P2和5种细胞因子下游引物做RT反应,用不同RT产物做PCR反应,结果表明,用5~10 μg RNA,以下游引物P2作RT反应,并取全部RT产物(20 μl)作PCR反应,能取得较好结果。

  2.RT-PCR检测5种细胞因子的电泳结果:以HT29细胞和Daudi细胞为例,经RT-PCR检测后,β-actin、IL-2、IFNγ、IL-4、IL-10、IL-13分别在500、458、494、456、249和300 bp处出现明显条带,与预定结果相符。

  3.RT-PCR和RNA斑点杂交结果的比较:两者的结果基本一致。两种方法同时应用,会取得准确结果。

  4.20种人肿瘤细胞株5种细胞因子的基因表达结果:包括结直肠癌、膀胱癌、黑色素瘤、乳腺癌和肺癌在内的11株实体瘤中,IL-2、IFNγ、IL-4、IL-10、IL-13的表达分别为1/11、2/11、9/11、10/11和10/11,包括淋巴瘤、骨髓瘤和白血病在内的9株血液系统肿瘤细胞株,上述5种细胞因子的表达依次为7/9、6/9、9/9、9/9和9/9。

  三、讨论

  RT-PCR是用来检测基因表达状况的一种快速、灵敏、特异的方法,并可进行半定量,在特异引物的引导下,可以从低丰度mRNA逆转录产物中扩增出近μg级的cDNA产物。通常进行重组克隆时,提取目的基因表达高丰度的细胞总RNA进行RT-PCR以获得目的DNA片断,20 μl RT反应体系只取5 μl即可进行PCR,最终的扩增产物10 μl即可以在1.5%琼脂糖电泳上观察出明显的条带。但在本次进行5种细胞因子基因表达的检测时发现,上述的方法不能获得肉眼可见的扩增条带,并且传统的Oligo dT12~18法在灵敏度和特异性方面与下游引物P2法相比都表现出极大的差距。于是,我们提取了1×105肿瘤细胞的总RNA,每种细胞因子的RT体系中加入5~10 μg RNA,将20 μl RT反应产物全部用于1种细胞因子的PCR,即获得了清晰的扩增带影。RT-PCR技术在具有高度灵敏性的同时,势必容易产生假阳性结果,出现非特异性的扩增条带。因此,进行RT-PCR时应注意:(1)引物设计的特异性;(2)PCR反应时适当提高退火温度;(3)PCR扩增产物应有相应的技术同时操作进行特异性鉴定,如Northern转印杂交、RNA斑点杂交、PCR产物电泳后转印杂交等。RNA斑点杂交是一种检测细胞因子的优选方法,该法忠实性强,可直观了解各种细胞因子的表达状况,并且操作过程中对RNA酶控制的要求可相对放松,便于掌握。但采用生物素标记探针进行RNA斑点杂交时,有时也会有非特异着色现象,可通过提高洗膜温度、延长洗膜时间等方法提高其特异性。该法的另一不足是操作繁琐,同时进行多个样品检测时易导致RNA降解,若控制好反应条件,可获得满意的结果。

参考文献

  1Abbas AK,Murphy KM, Sher A. Functional diversity of helper T lymphocytes. Nature,1996,383:787-793.

  2 Mosmann TR, Sad S.The expanding universe of T-cell subsets:Th1,Th2 and more.Im Today,1996,17:138-146.


来源:中华医学检验杂志    



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原始作者: 刘杰 魏海明 田志刚 冯进波 录入时间: 2006-9-20 17:29:15
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