重庆医科大学医学检验系创建于1983年，是经原国家教委于1983年批准设置的首批本科点之一，1986年、1990年先后在全国首批获临床检验诊断学硕士、博士学位授权点，1995年批准为博士后流动站；1992年、1999年成为四川省、直辖后重庆市的重点学科和重庆市卫生局首批重点学科，2000年被评为重庆市重点实验室，2001年评为重庆市“十五”期间重点建设的12个重点学科之一，2001年评为本专业唯一的国家级重点学科，一直担任全国高等医学教育学会医学检验教育分会理事长单位。该学科点的发展代表了我国检验医学高等教育的发展历程。
        医学检验系设有临床生化、临床微生物、临床免疫、临床血液、实验诊断、医学检验仪器学、生物分析化学七个专业、专业基础教研室和系临床检验诊断学实验室及临床医疗检验中心。教职员工62人，师资力量雄厚，有高级职称教师25人，其中教授10人，副教授15人(博士导师3名，硕士导师10人)。
       该学科点有细菌转化与毒素表达致细胞损伤的分子机制、肿瘤发生与逆转机制及分子诊断与治疗基础研究、正常菌群的微生态学研究及其开发应用、生物活性物质的分离分析方法学研究、妊娠失败与不良妊娠的分子遗传学诊断等5个稳定的研究方向。在研的国家自然科学基金项目6项（位居国内本专业第一），部委、省（市）级及横向科研项目23项，在研科研经费及各级重点学科、重点实验室建设经费413万元。获国家及省部级教学、科研成果奖12项，我系教师的发明专利及转化的产品已纳入国家级火炬计划项目。40人次参加卫生部研究生及本、专科规划教材、协编教材及教学参考书、课件编写，其中11本担任主编、副主编。近3年教师发表教学、科研论文102篇，其中多篇被EI、SCI、CSCD收录。
      医学检验系办学层次齐全，办学经验丰富，已招收博、硕、本、专科、成人层次学生，从2001年起我系开始招收七年制本-硕连读学生。培养毕业的博、硕士生数量均居国内同专业第一，博士生数量超过本专业其他学科点总和，为国内目前本专业规模最大、层次最齐全的人才培养基地。迄今，医学检验系共招收各层次学生二千余名，其中博士生68名，硕士生148名，本科生1002名。毕业生分布全国18个省市，深受用人单位好评。
     医学检验系坚持以学科建设为中心，在课程设置、教材建设、教学内容、师资队伍和学生能力培养上作了较大的探索和尝试。历经二十年艰苦奋斗，已经发展成为办学层次齐全，学科门类较为丰富，研究生教育初具规模，学术梯队趋于合理、课程体系独具特色，重视外语、计算机教育，学生就业前景广阔的学科，居于国内先进水平并起着重要作用。